某公司由于岗位特别多,为了省事,该公司将所有岗位危害因素进行了合并,所有员工做的体检项目都一样,这样有问题吗?

有问题。这样体检会发现很多假阳性(非真正的职业禁忌证或疑似职业病),比如为某不接触噪声的员工做了噪声的体检项目,若该员工听力本来就有问题,体检时很有可能判定为噪声职业禁忌证,之后处理这个问题就会很麻烦。